Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS50Q96JG6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms