Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms