Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP9XQ93008 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP9XQ93008 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms