Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SELENOMQ8WWX9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SELENOMQ8WWX9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SELENOMQ8WWX9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SELENOMQ8WWX9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SELENOMQ8WWX9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SELENOMQ8WWX9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SELENOMQ8WWX9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SELENOMQ8WWX9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SELENOMQ8WWX9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SELENOMQ8WWX9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SELENOMQ8WWX9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SELENOMQ8WWX9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SELENOMQ8WWX9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SELENOMQ8WWX9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SELENOMQ8WWX9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SELENOMQ8WWX9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SELENOMQ8WWX9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SELENOMQ8WWX9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SELENOMQ8WWX9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SELENOMQ8WWX9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SELENOMQ8WWX9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SELENOMQ8WWX9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SELENOMQ8WWX9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SELENOMQ8WWX9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SELENOMQ8WWX9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SELENOMQ8WWX9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SELENOMQ8WWX9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SELENOMQ8WWX9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SELENOMQ8WWX9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SELENOMQ8WWX9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SELENOMQ8WWX9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms