Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms