Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
SVBPQ8N300 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVBPQ8N300 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms