Protein–RNA interactions for Protein: Q86VZ5

SGMS1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1Q86VZ5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGMS1Q86VZ5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SGMS1Q86VZ5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGMS1Q86VZ5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGMS1Q86VZ5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGMS1Q86VZ5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGMS1Q86VZ5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGMS1Q86VZ5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGMS1Q86VZ5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGMS1Q86VZ5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGMS1Q86VZ5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SGMS1Q86VZ5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGMS1Q86VZ5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGMS1Q86VZ5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGMS1Q86VZ5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGMS1Q86VZ5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGMS1Q86VZ5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SGMS1Q86VZ5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGMS1Q86VZ5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGMS1Q86VZ5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGMS1Q86VZ5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGMS1Q86VZ5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGMS1Q86VZ5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGMS1Q86VZ5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGMS1Q86VZ5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGMS1Q86VZ5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGMS1Q86VZ5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGMS1Q86VZ5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGMS1Q86VZ5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGMS1Q86VZ5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGMS1Q86VZ5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms