Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY3Q7L099 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms