Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY69

ALDH1L2, Mitochondrial 10-formyltetrahydrofolate dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1L2Q3SY69 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALDH1L2Q3SY69 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALDH1L2Q3SY69 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALDH1L2Q3SY69 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ALDH1L2Q3SY69 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALDH1L2Q3SY69 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALDH1L2Q3SY69 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALDH1L2Q3SY69 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALDH1L2Q3SY69 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALDH1L2Q3SY69 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALDH1L2Q3SY69 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALDH1L2Q3SY69 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALDH1L2Q3SY69 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1L2Q3SY69 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1L2Q3SY69 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1L2Q3SY69 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1L2Q3SY69 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1L2Q3SY69 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1L2Q3SY69 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1L2Q3SY69 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1L2Q3SY69 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1L2Q3SY69 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1L2Q3SY69 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1L2Q3SY69 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1L2Q3SY69 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1L2Q3SY69 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1L2Q3SY69 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1L2Q3SY69 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1L2Q3SY69 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1L2Q3SY69 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1L2Q3SY69 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1L2Q3SY69 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1L2Q3SY69 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALDH1L2Q3SY69 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms