Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00303Q3SY05 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms