Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TLR1Q15399 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms