Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECTIN1Q15223 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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