Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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