Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKD2Q13563 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
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PKD2Q13563 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
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PKD2Q13563 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
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PKD2Q13563 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
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PKD2Q13563 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
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