Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPM6BQ13491 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPM6BQ13491 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms