Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 EMP3-209ENST00000599704 753 ntTSL 317.58■□□□□ 0.41e-15■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.021e-6■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 SUN2-202ENST00000405510 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.161e-6■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.315e-23■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 NACA-201ENST00000356769 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.45e-23■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 NACA-204ENST00000546392 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.575e-23■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 NACA-208ENST00000547914 543 ntTSL 59.52□□□□□ -0.895e-23■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 NACA-216ENST00000550952 2922 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.075e-23■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.135e-23■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.735e-23■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 TNNT1-206ENST00000586649 340 ntTSL 510.19□□□□□ -0.782e-10■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.281e-7■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 PPP2R5C-201ENST00000328724 4045 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.731e-7■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.192e-9■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.052e-9■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 CCNG1-210ENST00000511683 1071 ntTSL 211.47□□□□□ -0.572e-9■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 SCD-201ENST00000370355 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.816e-20■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.461e-6■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 SLC37A4-213ENST00000532085 5862 ntTSL 1 (best)17.31■□□□□ 0.361e-6■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.211e-6■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 SLC37A4-218ENST00000638186 2074 ntTSL 515.82■□□□□ 0.121e-6■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 SLC37A4-205ENST00000525102 2844 ntTSL 215.79■□□□□ 0.121e-6■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 SLC37A4-220ENST00000638925 2046 ntTSL 515.15■□□□□ 0.021e-6■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.011e-6■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 SLC37A4-219ENST00000638360 1912 ntTSL 515.09■□□□□ 0.011e-6■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.031e-6■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 SLC37A4-210ENST00000527992 2040 ntTSL 1 (best)14.49□□□□□ -0.091e-6■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 SLC37A4-208ENST00000526275 2626 ntTSL 1 (best)13.15□□□□□ -0.31e-6■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.092e-6■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.861e-6■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 PLK1-202ENST00000562272 4135 ntTSL 213.12□□□□□ -0.311e-6■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.313e-7■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.313e-7■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 PPP1R11-202ENST00000376763 1464 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.561e-16■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 PPP1R11-203ENST00000376765 1536 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.631e-16■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.271e-16■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 NDST1-201ENST00000261797 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.412e-9■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.814e-9■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 SNRNP70-204ENST00000595231 1673 ntTSL 1 (best)26.36■■□□□ 1.814e-9■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 SNRNP70-209ENST00000601065 1757 ntTSL 325.36■■□□□ 1.654e-9■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 SNRNP70-202ENST00000401730 3144 ntTSL 218.83■□□□□ 0.64e-9■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 SNRNP70-203ENST00000544278 3221 ntTSL 1 (best)17.57■□□□□ 0.44e-9■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 RPL37A-207ENST00000478153 2082 ntTSL 1 (best)24.72■■□□□ 1.555e-48■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 RPL37A-201ENST00000359681 742 ntTSL 1 (best)21.23■□□□□ 0.995e-48■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 RPL37A-212ENST00000600880 425 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.085e-48■■■□□ 19.1
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PABPC4Q13310 RPL37A-202ENST00000420712 385 ntTSL 510.96□□□□□ -0.655e-48■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 RPL37A-209ENST00000490649 1701 ntTSL 1 (best)10.75□□□□□ -0.695e-48■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 RPL37A-208ENST00000487233 2225 ntTSL 210.21□□□□□ -0.775e-48■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.055e-48■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.158e-7■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 C12orf57-201ENST00000229281 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.258e-7■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 C12orf57-202ENST00000537087 662 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.258e-7■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 C12orf57-207ENST00000545581 556 ntTSL 311.34□□□□□ -0.598e-7■■■□□ 19.1
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PABPC4Q13310 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.262e-6■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.892e-6■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 SEC11C-201ENST00000299714 727 ntTSL 515.92■□□□□ 0.142e-6■■■□□ 19.1
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PABPC4Q13310 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.571e-6■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.171e-6■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 SLC35A4-204ENST00000623481 683 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.368e-17■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 CDCA5-208ENST00000529290 789 ntTSL 520.49■□□□□ 0.872e-6■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.532e-6■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 CDCA5-210ENST00000533015 563 ntTSL 213.95□□□□□ -0.182e-6■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 CDCA5-206ENST00000525464 672 ntTSL 511.52□□□□□ -0.572e-6■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 PPID-201ENST00000307720 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.565e-8■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 C19orf60-204ENST00000595490 410 ntTSL 319.61■□□□□ 0.734e-10■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 RPS9-206ENST00000436445 752 ntTSL 217.16■□□□□ 0.343e-18■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 COX7A2-208ENST00000509698 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.337e-9■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 COX7A2-202ENST00000370089 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.647e-9■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 COX7A2-201ENST00000370081 914 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.767e-9■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 COX7A2-204ENST00000459637 501 ntTSL 25.41□□□□□ -1.547e-9■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.67e-9■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.257e-9■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 UBLCP1-201ENST00000296786 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.773e-8■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 UBLCP1-202ENST00000519276 1558 ntTSL 56.25□□□□□ -1.413e-8■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 11e-6■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 PKN1-209ENST00000587215 363 ntTSL 320.15■□□□□ 0.821e-6■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.761e-6■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 CDK13-203ENST00000465643 2394 ntTSL 1 (best)6.17□□□□□ -1.421e-6■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 FXR1-209ENST00000472339 2130 ntTSL 516.07■□□□□ 0.162e-6■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.052e-6■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 FXR1-220ENST00000491062 1768 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.272e-6■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 FXR1-211ENST00000475315 2341 ntTSL 212.62□□□□□ -0.392e-6■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 FXR1-201ENST00000305586 3277 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.412e-6■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 FXR1-207ENST00000468861 1989 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.482e-6■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 FXR1-202ENST00000357559 8711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.592e-6■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 FXR1-203ENST00000445140 2651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.772e-6■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.62e-7■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.382e-7■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.272e-7■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.242e-7■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.112e-7■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.882e-7■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.532e-7■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.392e-7■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 BID-207ENST00000494097 2429 ntTSL 1 (best)17.1■□□□□ 0.332e-7■■■□□ 19.1
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