Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 PCSK9-202ENST00000490692 3891 ntTSL 211.11□□□□□ -0.636e-7■■■■□ 20.2
TARDBPQ13148 ZFAND3-202ENST00000373389 531 ntTSL 511.14□□□□□ -0.631e-7■■■■□ 20.2
TARDBPQ13148 MYO18A-223ENST00000628822 7501 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.672e-8■■■■□ 20.2
TARDBPQ13148 MYO18A-209ENST00000531253 7504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.672e-8■■■■□ 20.2
TARDBPQ13148 MYO18A-202ENST00000527372 9992 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.72e-8■■■■□ 20.2
TARDBPQ13148 MYO18A-214ENST00000533112 7522 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.742e-8■■■■□ 20.2
TARDBPQ13148 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.112e-6■■■■□ 20.2
TARDBPQ13148 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.262e-6■■■■□ 20.2
TARDBPQ13148 ASH2L-203ENST00000517496 2194 ntTSL 212.5□□□□□ -0.412e-6■■■■□ 20.2
TARDBPQ13148 ASH2L-207ENST00000521652 2433 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.852e-6■■■■□ 20.2
TARDBPQ13148 ASH2L-202ENST00000428278 2678 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.912e-6■■■■□ 20.2
TARDBPQ13148 PIP4K2A-205ENST00000474335 559 ntTSL 215.53■□□□□ 0.081e-20■■■■□ 20.2
TARDBPQ13148 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.311e-6■■■■□ 20.2
TARDBPQ13148 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.091e-6■■■■□ 20.2
TARDBPQ13148 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.191e-6■■■■□ 20.2
TARDBPQ13148 MSI2-215ENST00000582453 496 ntTSL 34.02□□□□□ -1.771e-6■■■■□ 20.2
TARDBPQ13148 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.441e-6■■■■□ 20.2
TARDBPQ13148 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.461e-6■■■■□ 20.2
TARDBPQ13148 ATP11A-212ENST00000487903 8858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.751e-6■■■■□ 20.2
TARDBPQ13148 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.813e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.793e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.713e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.73e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 VEGFA-220ENST00000519767 970 ntTSL 1 (best)25.66■■□□□ 1.73e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.693e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.653e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.653e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.653e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.653e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.653e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.653e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.653e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.653e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.653e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.593e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.43e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.353e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.213e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 TMEM120B-201ENST00000342607 2766 ntTSL 221.98■■□□□ 1.113e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 CYFIP1-214ENST00000622576 583 ntTSL 421.5■■□□□ 1.033e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 ACSS2-213ENST00000480978 844 ntTSL 221.37■■□□□ 1.014e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.973e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 CNOT8-223ENST00000523270 575 ntTSL 420.39■□□□□ 0.853e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 AGAP3-209ENST00000469901 582 ntTSL 320.11■□□□□ 0.813e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.763e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 PTPRF-207ENST00000436724 2168 ntTSL 1 (best)19.54■□□□□ 0.723e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.693e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 SEPT8-209ENST00000414594 693 ntTSL 419.36■□□□□ 0.693e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 CORO7-211ENST00000572044 563 ntTSL 419.36■□□□□ 0.693e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 ANKLE1-208ENST00000598347 2003 ntTSL 219.29■□□□□ 0.683e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.683e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 ACSS2-211ENST00000477932 2450 ntTSL 519.13■□□□□ 0.654e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 ANKLE1-206ENST00000596626 2263 ntTSL 219.12■□□□□ 0.653e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.563e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 ACSS2-210ENST00000476922 1527 ntTSL 218.5■□□□□ 0.554e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.483e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.423e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.43e-6■■■■□ 20.1
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TARDBPQ13148 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.363e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 ZNF326-204ENST00000394583 1956 ntTSL 1 (best)17.16■□□□□ 0.343e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.333e-6■■■■□ 20.1
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TARDBPQ13148 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.313e-6■■■■□ 20.1
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TARDBPQ13148 CORO7-216ENST00000572549 663 ntTSL 516.72■□□□□ 0.273e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 SUGP1-210ENST00000589144 2066 ntTSL 1 (best)16.7■□□□□ 0.263e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.243e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 MIIP-203ENST00000466860 1709 ntTSL 516.48■□□□□ 0.231e-11■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.223e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.193e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.183e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.183e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 CORO7-223ENST00000574311 1737 ntTSL 516.14■□□□□ 0.173e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.173e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 SEPT8-215ENST00000492490 581 ntTSL 416.13■□□□□ 0.173e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 COPS7B-208ENST00000412591 571 ntTSL 416.1■□□□□ 0.173e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.163e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.143e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.143e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.143e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.143e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.133e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 CORO7-209ENST00000571756 1890 ntTSL 215.72■□□□□ 0.113e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 EPHX2-205ENST00000520623 1923 ntTSL 1 (best)15.7■□□□□ 0.13e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.093e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.073e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 POLE2-210ENST00000556584 1568 ntTSL 515.49■□□□□ 0.073e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 UBE2O-202ENST00000586409 3579 ntTSL 215.49■□□□□ 0.073e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 IQCE-206ENST00000422276 541 ntTSL 515.33■□□□□ 0.043e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 MIIP-205ENST00000478749 779 ntTSL 215.27■□□□□ 0.041e-11■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.023e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.014e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -01e-11■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.013e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 SUGP1-206ENST00000587119 2177 ntTSL 214.95□□□□□ -0.023e-6■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.023e-6■■■■□ 20.1
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