Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
STRN3Q13033 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
STRN3Q13033 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms