Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ABCE1P61221 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms