Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STX17P56962 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STX17P56962 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STX17P56962 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
STX17P56962 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
STX17P56962 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
STX17P56962 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STX17P56962 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STX17P56962 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STX17P56962 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
STX17P56962 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STX17P56962 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX17P56962 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX17P56962 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX17P56962 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX17P56962 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX17P56962 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX17P56962 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX17P56962 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX17P56962 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX17P56962 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX17P56962 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX17P56962 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX17P56962 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX17P56962 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX17P56962 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
STX17P56962 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX17P56962 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX17P56962 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX17P56962 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX17P56962 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
STX17P56962 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX17P56962 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX17P56962 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX17P56962 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX17P56962 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX17P56962 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX17P56962 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX17P56962 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX17P56962 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
STX17P56962 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
STX17P56962 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
STX17P56962 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
STX17P56962 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
STX17P56962 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
STX17P56962 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
STX17P56962 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
STX17P56962 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
STX17P56962 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
STX17P56962 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
STX17P56962 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
STX17P56962 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
STX17P56962 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
STX17P56962 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
STX17P56962 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
STX17P56962 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
STX17P56962 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
STX17P56962 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
STX17P56962 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX17P56962 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX17P56962 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX17P56962 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX17P56962 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX17P56962 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX17P56962 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX17P56962 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX17P56962 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX17P56962 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX17P56962 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX17P56962 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX17P56962 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX17P56962 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX17P56962 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX17P56962 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX17P56962 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX17P56962 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX17P56962 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX17P56962 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX17P56962 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX17P56962 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX17P56962 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX17P56962 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
STX17P56962 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX17P56962 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX17P56962 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX17P56962 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX17P56962 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX17P56962 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX17P56962 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX17P56962 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX17P56962 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
STX17P56962 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX17P56962 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
STX17P56962 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
STX17P56962 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
STX17P56962 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
STX17P56962 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
STX17P56962 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
STX17P56962 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
STX17P56962 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms