Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP12AP54707 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms