Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT6CP48668 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms