Protein–RNA interactions for Protein: P39059

COL15A1, Collagen alpha-1(XV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL15A1P39059 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL15A1P39059 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL15A1P39059 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL15A1P39059 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL15A1P39059 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL15A1P39059 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL15A1P39059 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL15A1P39059 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
COL15A1P39059 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL15A1P39059 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL15A1P39059 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL15A1P39059 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL15A1P39059 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL15A1P39059 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COL15A1P39059 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL15A1P39059 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL15A1P39059 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL15A1P39059 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COL15A1P39059 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL15A1P39059 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL15A1P39059 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL15A1P39059 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL15A1P39059 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL15A1P39059 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL15A1P39059 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL15A1P39059 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL15A1P39059 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL15A1P39059 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL15A1P39059 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL15A1P39059 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL15A1P39059 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COL15A1P39059 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COL15A1P39059 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COL15A1P39059 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL15A1P39059 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL15A1P39059 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL15A1P39059 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL15A1P39059 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL15A1P39059 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL15A1P39059 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms