Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms