Protein–RNA interactions for Protein: P35913

PDE6B, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6BP35913 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE6BP35913 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE6BP35913 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms