Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB3BP20337 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms