Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRPRAP08240 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
SRPRAP08240 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
SRPRAP08240 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRPRAP08240 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRPRAP08240 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRPRAP08240 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRPRAP08240 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRPRAP08240 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRPRAP08240 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRPRAP08240 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms