Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms