Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCER2I3L3R5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms