Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 FNDC3A-206ENST00000541916 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM217B-201ENST00000358293 5152 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 IPO13-202ENST00000372343 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 LIMCH1-205ENST00000503057 5467 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 ANK3-205ENST00000373827 7202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 ALOX12P2-210ENST00000574727 4326 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 BIVM-ERCC5-201ENST00000602836 5143 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCB1-201ENST00000265724 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP427-201ENST00000365323 119 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA35-201ENST00000386104 128 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 IGKV3D-11-201ENST00000390277 444 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR301B-201ENST00000390813 78 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 TRBV10-2-201ENST00000426318 395 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL856P-201ENST00000461754 298 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL573P-201ENST00000485340 276 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS10P20-201ENST00000494130 463 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 RPPH1-3P-201ENST00000516541 322 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1C-AS3-201ENST00000543559 444 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR5003-201ENST00000581891 99 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR3650-201ENST00000581972 60 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4786-201ENST00000583954 80 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 SNRPCP20-201ENST00000588011 210 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.142-201ENST00000612810 316 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL796P-201ENST00000613991 291 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 SEZ6L2-202ENST00000346932 3015 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 MYH8-201ENST00000403437 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 NBAS-201ENST00000281513 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 ALMS1-206ENST00000613296 12925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO7B-201ENST00000409090 3567 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 ATG13-207ENST00000526508 4199 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 CTNND1-237ENST00000534579 6024 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 MCM5-201ENST00000216122 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP3CB-202ENST00000360663 3501 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 TACC2-207ENST00000369000 3813 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 UBAP2L-201ENST00000271877 3997 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 SYT2-202ENST00000367268 7598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKRD6-218ENST00000522441 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRE-202ENST00000306042 4957 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 PTGS1-202ENST00000362012 4964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC113-201ENST00000219299 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 OPCML-203ENST00000524381 6424 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 ZSCAN20-201ENST00000361328 4316 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 CSPG4P4Y-201ENST00000333235 3724 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 CSPG4P3Y-201ENST00000418188 3724 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 AP3B2-215ENST00000620652 3729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 CFAP65-207ENST00000441968 3416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 ALDH1L1-203ENST00000393434 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 C9orf131-205ENST00000421362 3259 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 DIS3L2-204ENST00000409307 2658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 SUPT6H-201ENST00000314616 6523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 SIM1-202ENST00000369208 8430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 MYOM2-201ENST00000262113 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 EGF-201ENST00000265171 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 RAB18-201ENST00000356940 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 IYD-201ENST00000229447 7513 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 EXOC2-201ENST00000230449 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF366-201ENST00000318442 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 RBM12B-202ENST00000517700 6001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 CD28-201ENST00000324106 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFYVE1-201ENST00000318876 4362 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 VIPAS39-201ENST00000327028 2614 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 SPTAN1-203ENST00000372739 7868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 DHX9-201ENST00000367549 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 VLDLR-203ENST00000382100 9163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF391-201ENST00000244576 4079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 ZCCHC6-205ENST00000375960 4939 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 SAMD8-204ENST00000542569 6782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF827-201ENST00000379448 4197 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 CALML4-203ENST00000395465 4155 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 TTC26-202ENST00000430935 4198 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 CUX1-203ENST00000360264 13762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP4-12Q9BQ66 MYBPC2-201ENST00000357701 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.8 ms