Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.56
TNIKQ9UKE5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC31■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC31■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TNIKQ9UKE5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms