Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms