Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMBRD1Q9NUN5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBRD1Q9NUN5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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