Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A13Q9NSD5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms