Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms