Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GINS3Q9BRX5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms