Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms