Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
DCLRE1CQ96SD1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCLRE1CQ96SD1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCLRE1CQ96SD1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCLRE1CQ96SD1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCLRE1CQ96SD1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCLRE1CQ96SD1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCLRE1CQ96SD1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCLRE1CQ96SD1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCLRE1CQ96SD1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCLRE1CQ96SD1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCLRE1CQ96SD1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCLRE1CQ96SD1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCLRE1CQ96SD1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCLRE1CQ96SD1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCLRE1CQ96SD1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCLRE1CQ96SD1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCLRE1CQ96SD1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCLRE1CQ96SD1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCLRE1CQ96SD1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DCLRE1CQ96SD1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCLRE1CQ96SD1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCLRE1CQ96SD1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCLRE1CQ96SD1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCLRE1CQ96SD1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCLRE1CQ96SD1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCLRE1CQ96SD1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCLRE1CQ96SD1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms