Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHDC4Q8TBB5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms