Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC38A9Q8NBW4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms