Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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SMIM20Q8N5G0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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