Protein–RNA interactions for Protein: Q86YL7

PDPN, Podoplanin, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPNQ86YL7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDPNQ86YL7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms