Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
WDR88Q6ZMY6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
WDR88Q6ZMY6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
WDR88Q6ZMY6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
WDR88Q6ZMY6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
WDR88Q6ZMY6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR88Q6ZMY6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms