Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SUSD1Q6UWL2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms