Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms