Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC102BQ68D86 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms