Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC39AQ5SRH9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTC39AQ5SRH9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms