Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMGN3Q15651 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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