Protein–RNA interactions for Protein: Q14722

KCNAB1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB1Q14722 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNAB1Q14722 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNAB1Q14722 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNAB1Q14722 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNAB1Q14722 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNAB1Q14722 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNAB1Q14722 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNAB1Q14722 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNAB1Q14722 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNAB1Q14722 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNAB1Q14722 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNAB1Q14722 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNAB1Q14722 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNAB1Q14722 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNAB1Q14722 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNAB1Q14722 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNAB1Q14722 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNAB1Q14722 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNAB1Q14722 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNAB1Q14722 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms