Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.23e-9■□□□□ 10
G3BP1Q13283 CALM2-203ENST00000432899 1004 ntTSL 516.6■□□□□ 0.253e-9■□□□□ 10
G3BP1Q13283 CALM2-206ENST00000482532 1891 ntTSL 213.69□□□□□ -0.223e-9■□□□□ 10
G3BP1Q13283 STPG4-206ENST00000422269 983 ntTSL 213.64□□□□□ -0.233e-9■□□□□ 10
G3BP1Q13283 CALM2-202ENST00000409563 770 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.493e-9■□□□□ 10
G3BP1Q13283 CALM2-204ENST00000456319 703 ntTSL 24.09□□□□□ -1.753e-9■□□□□ 10
G3BP1Q13283 CALM2-205ENST00000460218 4502 ntTSL 1 (best)2.02□□□□□ -2.093e-9■□□□□ 10
G3BP1Q13283 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.389e-7■□□□□ 10
G3BP1Q13283 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.319e-7■□□□□ 10
G3BP1Q13283 SARS-205ENST00000477544 694 ntTSL 212.85□□□□□ -0.359e-7■□□□□ 10
G3BP1Q13283 HNRNPD-210ENST00000514325 4597 ntTSL 1 (best)5.55□□□□□ -1.521e-7■□□□□ 10
G3BP1Q13283 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.021e-6■□□□□ 10
G3BP1Q13283 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.931e-6■□□□□ 10
G3BP1Q13283 HSPD1-209ENST00000452200 888 ntTSL 511.07□□□□□ -0.642e-21■□□□□ 10
G3BP1Q13283 HSPD1-208ENST00000440114 619 ntTSL 59.53□□□□□ -0.882e-21■□□□□ 10
G3BP1Q13283 HSPD1-206ENST00000430176 754 ntTSL 56.34□□□□□ -1.392e-21■□□□□ 10
G3BP1Q13283 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.237e-8■□□□□ 10
G3BP1Q13283 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.167e-8■□□□□ 10
G3BP1Q13283 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.057e-8■□□□□ 10
G3BP1Q13283 NDUFB9-205ENST00000518657 672 ntTSL 210.06□□□□□ -0.87e-8■□□□□ 10
G3BP1Q13283 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.642e-17■□□□□ 10
G3BP1Q13283 APLP2-219ENST00000533616 2041 ntTSL 223.42■■□□□ 1.342e-17■□□□□ 10
G3BP1Q13283 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.172e-17■□□□□ 10
G3BP1Q13283 APLP2-207ENST00000525604 1590 ntTSL 220.19■□□□□ 0.822e-17■□□□□ 10
G3BP1Q13283 APLP2-222ENST00000533860 1424 ntTSL 1 (best)19.37■□□□□ 0.692e-17■□□□□ 10
G3BP1Q13283 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.252e-17■□□□□ 10
G3BP1Q13283 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.062e-17■□□□□ 10
G3BP1Q13283 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.032e-17■□□□□ 10
G3BP1Q13283 APOE-202ENST00000425718 923 ntTSL 1 (best)29.88■■■□□ 2.376e-37■□□□□ 10
G3BP1Q13283 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.126e-37■□□□□ 10
G3BP1Q13283 APOE-204ENST00000446996 737 ntTSL 227.26■■□□□ 1.956e-37■□□□□ 10
G3BP1Q13283 APOE-203ENST00000434152 864 ntTSL 225.11■■□□□ 1.616e-37■□□□□ 10
G3BP1Q13283 PRDX3-202ENST00000463322 450 ntTSL 23.94□□□□□ -1.785e-9■□□□□ 10
G3BP1Q13283 GPI-206ENST00000587384 810 ntTSL 323.02■■□□□ 1.283e-12■□□□□ 10
G3BP1Q13283 PHGDH-207ENST00000496756 508 ntTSL 216.02■□□□□ 0.162e-8■□□□□ 10
G3BP1Q13283 EIF3B-207ENST00000465670 2766 ntTSL 217■□□□□ 0.313e-6■□□□□ 10
G3BP1Q13283 COASY-206ENST00000587157 551 ntTSL 413.54□□□□□ -0.244e-7■□□□□ 10
G3BP1Q13283 TXNIP-202ENST00000486597 509 ntTSL 25.84□□□□□ -1.476e-14■□□□□ 10
G3BP1Q13283 NMT1-207ENST00000588455 585 ntTSL 212.27□□□□□ -0.453e-7■□□□□ 10
G3BP1Q13283 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.413e-8■□□□□ 10
G3BP1Q13283 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.053e-8■□□□□ 10
G3BP1Q13283 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.563e-8■□□□□ 10
G3BP1Q13283 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.363e-8■□□□□ 10
G3BP1Q13283 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.922e-6■□□□□ 10
G3BP1Q13283 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.772e-6■□□□□ 10
G3BP1Q13283 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.712e-6■□□□□ 10
G3BP1Q13283 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.252e-6■□□□□ 10
G3BP1Q13283 KDM5B-208ENST00000491153 596 ntTSL 29.69□□□□□ -0.864e-6■□□□□ 10
G3BP1Q13283 SEC31A-213ENST00000503937 1564 ntTSL 1 (best)8.71□□□□□ -1.029e-7■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 MARS-223ENST00000551431 559 ntTSL 423.62■■□□□ 1.374e-7■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.363e-8■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.353e-8■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 SLC3A2-213ENST00000539458 565 ntTSL 521.52■■□□□ 1.043e-8■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.973e-8■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 SLC3A2-221ENST00000544377 589 ntTSL 420.63■□□□□ 0.893e-8■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.823e-8■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.73e-8■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 SLC3A2-216ENST00000541372 269 ntTSL 519.12■□□□□ 0.653e-8■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 SLC3A2-211ENST00000538084 741 ntTSL 318.36■□□□□ 0.533e-8■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 GSTO1-205ENST00000470554 547 ntTSL 217.33■□□□□ 0.365e-14■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 ACTB-208ENST00000464611 715 ntTSL 510.26□□□□□ -0.774e-44■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.091e-6■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 IST1-205ENST00000439924 1841 ntTSL 514.82□□□□□ -0.041e-6■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 IST1-215ENST00000538850 1125 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.191e-6■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 IST1-201ENST00000329908 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.211e-6■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 IST1-206ENST00000456820 2031 ntTSL 513.61□□□□□ -0.231e-6■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 IST1-213ENST00000538565 1245 ntTSL 213.48□□□□□ -0.251e-6■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 IST1-202ENST00000378798 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.321e-6■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 IST1-226ENST00000606369 3583 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.741e-6■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 UBR4-206ENST00000419533 5583 ntTSL 510.38□□□□□ -0.758e-7■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 IST1-208ENST00000535424 4082 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.941e-6■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.761e-6■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 HMGCR-201ENST00000287936 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.462e-9■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 HMGCR-207ENST00000509085 637 ntTSL 1 (best)10.75□□□□□ -0.692e-9■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 HMGCR-210ENST00000511986 487 ntTSL 510.19□□□□□ -0.782e-9■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 HMGCR-202ENST00000343975 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.792e-9■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 HMGCR-212ENST00000514315 603 ntTSL 38.53□□□□□ -1.042e-9■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.082e-9■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 UQCRC2-201ENST00000268379 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.361e-7■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 UQCRC2-202ENST00000561553 1415 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.841e-7■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 UQCRC2-205ENST00000563898 1406 ntTSL 58.14□□□□□ -1.111e-7■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 SSB-212ENST00000494051 392 ntTSL 25.44□□□□□ -1.542e-7■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 SSB-211ENST00000490914 754 ntTSL 53.51□□□□□ -1.852e-7■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 SND1-216ENST00000492840 472 ntTSL 56.11□□□□□ -1.431e-11■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 EWSR1-205ENST00000360091 1289 ntTSL 524.24■■□□□ 1.472e-8■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 EWSR1-218ENST00000483629 1818 ntTSL 522.45■■□□□ 1.192e-8■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 MARS-227ENST00000552007 434 ntTSL 326.48■■□□□ 1.833e-7■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.673e-7■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 MARS-232ENST00000553162 575 ntTSL 224.7■■□□□ 1.543e-7■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 MARS-208ENST00000547501 510 ntTSL 223.62■■□□□ 1.373e-7■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 MARS-221ENST00000550449 739 ntTSL 322.49■■□□□ 1.193e-7■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 MARS-231ENST00000553123 724 ntTSL 29.77□□□□□ -0.853e-7■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 HNRNPD-211ENST00000514671 1089 ntTSL 510.49□□□□□ -0.739e-8■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 NDUFB9-207ENST00000524241 654 ntTSL 28.84□□□□□ -0.991e-7■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.167e-8■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 TFRC-201ENST00000360110 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.77e-8■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 TFRC-203ENST00000420415 4814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.827e-8■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 FNDC3B-202ENST00000415807 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.114e-7■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 FNDC3B-201ENST00000336824 7904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.564e-7■□□□□ 9.9
G3BP1Q13283 FNDC3B-203ENST00000416957 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.94e-7■□□□□ 9.9
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